Mặc dù đã giành vé đi tiếp nhưng Bayern Munich không hề có ý định buông trong cuộc chiến với Olympiacos. Thay vào đó, thày trò Pep Guardiola đã hủy diệt đối thủ với tỷ số 4-0 và đích thân Thomas Muller cũng đóng góp 1 bàn.
Chiến thắng ấy đã đưa Thomas Muller vào lịch sử Champions League. Theo đó, anh là người trẻ nhất cán cột mốc 50 trận thắng ở đấu trường này (ở 26 tuổi 72 ngày).
Trước đó, huyền thoại Real Madrid, Raul là người nắm giữ kỷ lục này ở 26 tuổi 257 ngày. Leo Messi đứng thứ 3, khi cán mốc 50 chiến thắng cùng Barcelona ở 27 tuổi và 134 ngày.
Đứng tiếp sau là hai thành viên của Real Madrid, đó là Iker Casillas (27 tuổi 189 ngày) và C.Ronaldo (28 tuổi 28 ngày).
Thomas Muller ra mắt Champions League ở tuổi 19 trong trận đấu với Sporting Lisbon vào tháng 3/2009. Tới nay, anh đã ra sân trong 75 trận đấu ở giải đấu này và ghi được 33 bàn thắng.