Ở trận đấu bù vòng 23, Slovan Liberec thất bại 0-2 trước Teplice và bỏ lỡ cơ hội đánh chiếm Top 6, nhóm vào tranh chức vô địch cùng 5 tấm vé dự các cúp châu Âu, ở giai đoạn 2. Đó là trận đấu mà Filip Nguyễn không thể giúp đội nhà giành lấy điểm số sau sai lầm ở hàng thủ.

Bước vào vòng 25, Slovan Liberec làm khách trên sân của Ceske Budejovice, đội bóng xếp ngay sau họ. Với lợi thế sân nhà, Ceske Budejovice chiếm thế chủ động trong 45 phút đầu tiên. Hàng loạt cơ hội được tạo ra song sự xuất sắc của Filip Nguyễn khiến các chân sút chủ nhà nản lòng. Đáng chú ý là hai pha giải nguy từ những cú dứt điểm cận thành của đối phương.

Cầm chân chủ nhà sau giờ nghỉ, Slovan Liberec đánh phủ đầu đối phương ở hiệp 2. Đến phút 50, họ có bàn thắng với pha lập công của Baluta. Bị dẫn bàn, Ceske Budejovice tràn lên tấn công. Filip Nguyễn chỉ huy tốt hàng phòng ngự để giúp đội nhà giữ sạch mành lưới, qua đó giành chiến thắng với tỷ số 1-0.

Ba điểm giúp Slovan Liberec vươn lên vị trí thứ 4 với 39 điểm. Giai đoạn 1 của giải VĐQG CH Czech chỉ còn 5 vòng khép lại, nếu giữ sự ổn định, Filip Nguyễn cùng đồng đội tràn trề lọt vào Top 6, qua đó sáng cửa giành vé dự các cúp châu Âu mùa sau.

Cũng ở vòng đấu này, một đội bóng của thủ môn Việt kiều khác cũng giành trọn vẹn ba điểm. Đó là chiến thắng tưng bừng 4-0 của Bohemians trước Teplice. Tuy vậy, Patrik Lê Giang lại dự bị ở trận đấu này.