Ở bảng A, Hà Nội FC mất quyền tự quyết cho tấm vé vào VCK. Họ buộc phải thắng Luxury Hạ Long và chờ cặp đấu còn lại giữa Nam Định vs Viettel không có kết quả hòa từ 2 bàn thắng trở lên. Kết quả chung cuộc, Nam Định và Viettel hòa 2-2 để dắt tay nhau vào VCK, tiễn ĐKVĐ Hà Nội ngay vòng loại.
Đây không phải là bất ngờ duy nhất ở vòng đấu loại U21 Quốc gia năm nay. Tại bảng C, HAGL có lợi thế sân nhà, lại nắm quyền tự quyết cho tấm vé đi tiếp ở lượt trận cuối. Họ chỉ cần không thua SLNA sẽ hoàn thành mục tiêu. Bởi trước vòng đấu cuối, U21 HAGL có 4 điểm, cùng số điểm với CAND và hơn SLNA 1 điểm.
Thế nhưng, đội bóng phố Núi đã tự tay đánh mất cơ hội sau trận thua 2-3 trước chính đối thủ đến từ xứ Nghệ. Ở trận đấu còn lại, CAND có chiến thắng vừa đủ 1-0 trước Tây Ninh để giành tấm vé vào VCK. Đáng nói, rất nhiều cầu thủ của U21 HAGL từng khoác áo CAND thi đấu ở giải hạng Nhì 2020.
Hà Nội và HAGL trải qua một năm 2020 đáng quên ở mọi cấp độ. Đội bóng Thủ đô chỉ có thể vô địch Cúp QG và bị Viettel vượt mặt ở V.League. Các giải đấu trẻ, họ không có kết quả khả quan khi không vô địch lứa U nào. HAGL còn thảm bại hơn với thành tích không tốt từ đội 1 đến các lứa U.
8 đội lọt vào VCK U21 Quốc gia 2020: Nam Định, Viettel, Phố Hiến, CAND, SLNA, Long An, Đồng Tháp và chủ nhà Khánh Hòa.