Có một câu chuyện khá ầm ỹ diễn ra ngay trước ngày đội bóng đất Mỏ chuẩn bị trận đấu mở màn ở vòng 1 V.League 2016 với S.Khánh Hoà BVN. Do bất đồng trong cách sắp xếp nhân sự trên sân, khi quyết định đẩy một cầu thủ vốn từng chơi rất hay ở vị trí hành lang cánh mùa giải trước lên trên hành tiền đạo, HLV Như Thuần bị vấp phải sự phản đối mạnh mẽ. Cho rằng mình bị ông thầy cố tình “âm mưu để vùi dập”, với việc phải cạnh tranh vị trí cùng 2 tiền đạo ngoại, cầu thủ này thể hiện thái độ bức xúc ra mặt và ngay trong buổi họp trước toàn đội đã không ngần ngại đứng lên “nói chuyện phải quấy” với nhà cầm quân này.

Một ví dụ cho thấy ở T.Quảng Ninh, HLV Như Thuần không nhận được tôn trọng và mất đi cái uy vốn có của một người thầy trong mắt học trò. Và thực tế, đấy không phải là lần đầu tiên từ ngày về dẫn dắt T.Quảng Ninh, Như Thuần bị các cầu thủ phản ứng và bày tỏ sự không hài lòng trước cách làm có phần độc đoán, thể hiện cái tôi quá lớn.

HLV Như Thuần về với T.Quảng Ninh theo diện khá đặc biệt. Khi đang làm ở Phòng ĐTQG, cựu tuyển thủ QG này được một lãnh đạo VFF đứng ra giới thiệu, đảm bảo cho đội bóng đất Mỏ khi đó đang cần “chữa cháy” cuối mùa giải 2015 vì HLV Đinh Cao Nghĩa rút lui. Do liên quan đến quan hệ làm ăn và những lý do ngoài chuyên môn, ông thầy này không nhận được nhiều sự tôn trọng từ cầu thủ. Dù biết được làn sóng phản đối cùng bất mãn từ chính đội bóng cũng như giới CĐV, lãnh đạo T.Quảng Ninh quan điểm ủng hộ đến phút cuối. Tuy nhiên, việc họ mời HLV Phan Thanh Hùng về làm GĐKT như là cách để “dọn đường” và khi ý thức được cái thế khó của mình cũng như lãnh đạo, HLV Phạm Như Thuần đã chủ động rút lui.